使用 Seq-Scope 对空间转录组进行显微镜检查.

空间条形码技术有可能揭示组织学
转录组轮廓的详细信息; 然而, 他们目前受到限制
他们的低分辨率. 这里, 我们报告SEQ-SCOPE, 空间条形码
具有与光学显微镜相当的分辨率的技术. seq-scope
基于随机条形码的固相扩增
使用Illumina测序平台的单分子寡核苷酸. 这
用空间坐标注释的结果簇被处理为
暴露RNA捕获部分. 这些RNA捕获条形码簇定义了
Seq-Scope的像素彼此之间约为0.5-0.8μm. 来自组织
部分, Seq-Scope可视化空间转录组异质性
多个组织学量表, 包括组织分区根据
门户中心 (肝), 地下表面 (冒号) 和炎症纤维化
(受伤的肝脏) 轴, 细胞组件，包括单细胞类型和
亚型, 核和细胞质的亚细胞体系结构. seq-scope
很快, 直截了当, 精确的, 和易于实现，使空间
一组生物医学研究人员可以访问单细胞分析.