Las puntuaciones de riesgo poligénico de los endofenotipos identifican el efecto de los antecedentes genéticos en la cardiopatía congénita

Cardiopatía congénita (enfermedad coronaria) Es un defecto estructural poco común que ocurre en aproximadamente el 1% de los nacidos vivos.. Los estudios sobre la arquitectura genética de las enfermedades coronarias han identificado mutaciones patógenas de un solo gen en menos de 30% de casos. Las mutaciones de un solo gen a menudo muestran penetrancia incompleta y expresividad variable.. Por lo tanto, Presumimos que los antecedentes genéticos pueden desempeñar un papel en la modulación de la expresión de la enfermedad.. Puntuaciones de riesgo poligénico (PRS) efectos agregados de variantes genéticas comunes para investigar si, acumulativamente, estas variantes están asociadas con la penetrancia o la gravedad de la enfermedad. Sin embargo, Las principales limitaciones en este campo han sido generar tamaños de muestra suficientes para estos estudios.. Aquí utilizamos un estudio de asociación de todo el genoma emparejado con fenotipo CHD (GWAS) estadísticas resumidas del Biobanco del Reino Unido (Reino Unido) como nuestro estudio base y datos de secuenciación del genoma completo de la cohorte CHD (n1 = 711 tríos, n2 = 362 tríos europeos) del conjunto de datos Gabriella Miller Kids First como nuestro estudio objetivo para desarrollar PRS para CHD. Las PRS estimadas utilizando un GWAS para problemas de válvulas cardíacas y soplos cardíacos explican 2.5% de la varianza en el estado de casos y controles de CHD (todos los SNV, pag = 7.90 × 10-3; SNV cardíacas fetales, pag = 8.00 × 10-3) y 1.8% de la varianza en la gravedad de la enfermedad coronaria (SNV cardíacas fetales, pag = 6.20 × 10-3; todos los SNV, pag = 0.015). Estos resultados muestran que las variantes comunes capturadas en GWAS con fenotipo coincidente de CHD tienen una contribución modesta pero significativa a la expresión fenotípica de CHD.. Es necesaria una mayor exploración del efecto acumulativo de variantes comunes para comprender la compleja etiología genética de la enfermedad coronaria y otras enfermedades raras..