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先天性疾病

孩子第一: 染色体 18 结构性出生缺陷

NIH X01 项目摘要 - 珍妮·德·玛斯·科迪, PI
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单独的 gVCF
发布日期
十一月 29, 2023
先天性疾病

孩子第一: 隐性结构性脑缺陷

NIH X01 项目摘要 - 约瑟夫·格里森, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
十月 23, 2023
先天性疾病

孩子第一: 食管闭锁和气管食管瘘

NIH X01 项目摘要 - 钟温迪, PI
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发布日期
八月 23, 2023
先天性疾病

孩子第一: 神经管的结构缺陷

NIH X01 项目摘要 - 约瑟夫·格里森, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
八月 7, 2023
癌症

孩子第一: 颅内生殖细胞肿瘤

NIH X01 项目摘要 - 刘青, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
六月 6, 2023
先天性疾病

孩子第一: 胎儿酒精谱系障碍

NIH X01 项目摘要 - 克里斯蒂娜·钱伯斯, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
可能 15, 2023
先天性疾病

孩子第一: 口面部裂痕 – 菲律宾

NIH X01 项目摘要 - 伊丽莎白·莱斯利, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
可能 9, 2023
先天性疾病

孩子第一: 电荷综合症

NIH X01 项目摘要 - 唐娜·马丁, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
四月 27, 2023
先天性疾病

孩子第一: 偏侧性出生缺陷

NIH X01 项目摘要 - 斯蒂芬妮·韦尔, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
行进 12, 2023
先天性疾病

孩子第一: 膀胱外翻, 尿道上裂, 复杂的

NIH X01 项目摘要 - 安吉杰琳, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
十月 18, 2022
先天性疾病

孩子第一: 科妮莉亚·德·朗格综合症

NIH X01 项目摘要 - 伊恩·克兰兹, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
九月 12, 2022
癌症

孩子第一: T细胞ALL

NIH X01 项目摘要 - 大卫·蒂奇, PI
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单独的 gVCF
VCF
基因表达 TSV
发布日期
十一月 2, 2021
交叉条件

孩子第一: 白血病 & 唐氏综合症的心脏缺陷

NIH X01 项目摘要 - 菲利普·卢波和斯蒂芬妮·谢尔曼, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
九月 28, 2021
癌症

孩子第一: 骨髓恶性肿瘤

NIH X01 项目摘要 - 索海尔·梅辛奇, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
九月 23, 2021
先天性疾病

孩子第一: 血管瘤 (PHACE)

NIH X01 项目摘要 - 道恩·西格尔, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
八月 23, 2021
先天性疾病

孩子第一: 非综合征性颅缝早闭

NIH X01 项目摘要 - 西蒙·博伊德, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
八月 23, 2021
交叉条件

孩子第一: 癌症的交叉点 & SBD

NIH X01 项目摘要 - 哈科纳森, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
六月 10, 2021
癌症

目标: 急性髓系白血病

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发布日期
行进 29, 2021
先天性疾病

孩子第一: 小耳症 – 西班牙裔

NIH X01 项目摘要 - 乔纳森·赛德曼, PI
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发布日期
十二月 17, 2020
先天性疾病

孩子第一: 肾脏和尿路缺陷

NIH X01 项目摘要 - 阿里·加拉维, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
十二月 2, 2020
先天性疾病

孩子第一: 颅面微小症

NIH X01 项目摘要 - 丹妮拉·卢凯蒂, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
十一月 18, 2020
癌症

孩子第一: 骨肉瘤

NIH X01 项目摘要 - 凯南·奥内尔, PI
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发布日期
八月 24, 2020
癌症

孩子第一: 家庭中新的癌症易感性 (从 BASIC3)

NIH X01 项目摘要 - 莎朗·普伦, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
未对齐读取
发布日期
七月 21, 2020
先天性疾病

孩子第一: 口面裂 – 非洲和亚洲血统

NIH X01 项目摘要 - 阿齐兹·布塔利和特丽·贝蒂, PI
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单独的 gVCF
发布日期
六月 23, 2020
癌症

孩子第一: 家族性白血病

NIH X01 项目摘要 - 查尔斯·穆里根, PI
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未对齐读取
VCF
发布日期
六月 17, 2020
癌症

孩子第一: 内生软骨瘤病

NIH X01 项目摘要 - 奈拉·索布雷拉, PI
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未对齐读取
VCF
发布日期
四月 10, 2020
癌症

孩子第一: 成神经细胞瘤

NIH X01 项目摘要 - 约翰·马里斯, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
未对齐读取
基因表达 TSV
发布日期
九月 25, 2019
癌症

儿童脑肿瘤图谱: 菲律宾国家石油公司

中国BTTC网站
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基因表达 TSV
带注释的体细胞突变
基因融合
体细胞拷贝数变异
同种型表达
发布日期
七月 25, 2019
先天性疾病

孩子第一: 口面裂 – 拉丁美洲人

NIH X01 项目摘要 - 玛丽·马拉兹塔, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
六月 27, 2019
癌症

目标: 成神经细胞瘤

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发布日期
行进 29, 2019
先天性疾病

孩子第一: 性发育障碍

NIH X01 项目摘要 - 埃里克·维兰, PI
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单独的 gVCF
发布日期
行进 26, 2019
05/28/2019
Data shape changes to support the Kids First Data Resource Portal


04/29/2019
Data shape changes to support the Kids First Data Resource Portal


02/05/2019
Major release for back end structural changes in preparation to release family-based joint genotyping files. Removed 37 participants & data for further genomic QC review. Full details can be found on this sheet (linked here)


11/05/2018
Published major release to account for underlying data model changes to add method_of_sample_procurement on biospecimen and to make HPO terms searchable by their standard name alongside their code.


10/11/2018
Initial portal release


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先天性疾病

孩子第一: 青少年特发性脊柱侧弯

NIH X01 项目摘要 - 乔纳森·里奥斯, PI
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单独的 gVCF
发布日期
十月 12, 2018
05/28/2019
Data shape changes to support the Kids First Data Resource Portal


04/29/2019
Data shape changes to support the Kids First Data Resource Portal


04/23/2019
Added back GRCh38 harmonized data for all samples. This adds back the missing reads in the q-arm of ChrX Updated the list of samples hidden that are undergoing further genomic QC Review (listed here)


02/08/2019
Removed all GRCh38 harmonized data per latest Known Issue impacted by the missing reads in the q-arm of ChrX


02/05/2018
Major release for back end structural changes in preparation to release family-based joint genotyping files Removed 50 participants & data for further genomic QC review. Full details can be found on this sheet (listed here)


11/05/2018
Published major release to account for underlying data model changes to add method_of_sample_procurement on biospecimen and to make HPO terms searchable by their standard name alongside their code


10/11/2018
Released data model change to move Consent Type from Participant to Biospecimen


10/05/2018
Mapped the harmonized files created by the DRC to the source genomic files’ sequencing experiment. This allows both source & harmonized files to be searchable when filtering on Experiment Strategy.


09/18/2018
Fixed participant with missing family ID. PT_BX9B2A7T now has the correct family ID Updated participant consent types to align with dbGaP


09/10/2018
Initial version release of this study as part of the Kids First Data Resource Center. Latest dbGaP release notes (linked here)


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先天性疾病

孩子第一: 颅神经神经缺失综合征

NIH X01 项目摘要 - 伊丽莎白·恩格尔, PI
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单独的 gVCF
发布日期
八月 23, 2018
癌症

孩子第一: 尤文肉瘤 – 遗传风险

NIH X01 项目摘要 - 约书亚希夫曼, PI
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单独的 gVCF
发布日期
六月 18, 2018

Data shape changes to support the Kids First Data Resource Portal


05/24/2019
Initial release of family-based VCFs



Data shape changes to support the Kids First Data Resource Portal



Updated consents & ACLS in accordinace with latest dbGaP release



Added in FY16 samples in coordination with latest dbGaP release Added in GRCh38 harmonized data for both FY15 & FY16 samples. This adds back the missing reads in the q-arm of ChrX


02/08/2019
Removed all GRCh38 harmonized data per latest Known Issue impacted by the missing reads in the q-arm of ChrX


02/05/2019
Major release for back end structural changes in preparation to release family-based joint genotyping files


11/05/2018
Published major release to account for underlying data model changes to add method_of_sample_procurement on biospecimen and to make HPO terms searchable by their standard name alongside their code


10/11/2018
Released data model change to move Consent Type from Participant to Biospecimen


10/05/2018
Mapped the harmonized files created by the DRC to the source genomic files’ sequencing experiment. This allows both source & harmonized files to be searchable when filtering on Experiment Strategy.


09/18/2018
The study was successfully decoupled from its parent study. As part of this, the data is now downloadable from the portal for those who have been granted dbGaP access. Updated participant consent types to align with dbGaP.


09/10/2018
Initial versioned release of this study as part of the Kids First Data Resource Center https://commonfund.nih.gov/kidsfirst/2015X01projects#Seidman


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先天性疾病

孩子第一: 先天性心脏缺陷

NIH X01 项目摘要 - 克里斯汀·赛德曼, PI
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单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
六月 18, 2018
06/21/2019
Removed family-based VCF for family GMKF0695 containing participants PA2026, PA2028, PA2027 as one participant had genomic QC issues


05/28/2019
Data shape changes to support the Kids First Data Resource Portal


05/24/2019
Initial release of family-based VCFs


04/29/2019
Data shape changes to support the Kids First Data Resource Portal


04/10/2019
Added additional samples to the study in conjunction with dbGaP release Added back harmonized data for the files removed on 2/8/19


02/08/2019
Removed the following GRCh38 harmonized files per latest Known Issue impacted by the missing reads in the q-arm of ChrX (listed here)


02/05/2019
Major release for back end structural changes in preparation to release family-based joint genotyping files Removed small number of participants for further genomic QC review (listed here)


11/05/2018
Originally IA3006 was proband with parents IA3004 and IA3005. Now, IA3004 is proband with parents IA3005 and IA3006 Published major release to account for underlying data model changes to add method_of_sample_procurement on biospecimen and to make HPO terms searchable by their standard name alongside their code.


10/11/2018
Released data model change to move Consent Type from Participant to Biospecimen.


10/05/2018
Mapped the harmonized files created by the DRC to the source genomic files’ sequencing experiment. This allows both source & harmonized files to be searchable when filtering on Experiment Strategy.


09/18/2018
Removed the following biospecimens due to QC issues found during genomic data review. External Participant & Sample ID -> Exclusion Reason MD0031 -> Uncertain Identity of samples MD0032 -> Uncertain Identity of samples MD0033 -> Uncertain Identity of samples MD0280 -> Uncertain Identity of samples MD0281 -> Uncertain Identity of samples MD0282 -> Uncertain Identity of samples PA2063 -> Uncertain identity of sample PA2027 -> Uncertain identity of sample PA2200 -> High missing rate PA2254 -> Duplicate of another sample IA2650 -> Uncertain identity of samples IA2651 -> Uncertain identity of samples IA2652 -> Uncertain identity of samples IA2836 -> Uncertain identity of samples IA2837 -> Uncertain identity of samples IA2838 -> Uncertain identity of samples IA4062 -> High missing rate MD3181 -> High Het/Hom ratio IA4019 -> High missing rate IA4022 -> High missing rate IA3038 -> Definitely unrelated to offspring IA4054 -> High missing rate


09/10/2018
Initial versioned release of this study as part of the Kids First Data Resource Center. Latest dbGaP release notes found here.


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先天性疾病

孩子第一: 口面裂 – 欧洲血统

NIH X01 项目摘要 - 玛丽·马拉兹塔, PI
对齐读取
单独的 gVCF
基于家庭的 VCF
发布日期
六月 18, 2018
癌症

儿童脑肿瘤图谱: 中国贸易技术委员会

中国BTTC网站
对齐读取
VCF
发布日期
六月 18, 2018
先天性疾病

孩子第一: 先天性膈疝

NIH X01 项目摘要 - 钟温迪, PI
对齐读取
单独的 gVCF
发布日期
二月 18, 2018

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