El Sociedad Americana de Genómica Humana (ASHG) es la principal organización de membresía profesional para especialistas en genética humana, con una base de miembros de casi 8,000 profesionales en todo el mundo. Cada año un reunión del ASHG se lleva a cabo para reunir a los expertos del campo para compartir la ciencia emergente, herramientas, y marcos.
El Centro de recursos de datos Gabriella Miller Kids First, financiado por el Fondo Común de los NIH (Niños primero RDC) estaba feliz de participar una vez más en la reunión anual, celebrado virtualmente en Zoom a partir de octubre 18 a 22. Para el 2021 reunión, Kids First DRC presentó una demostración especial y Q&Una sesión dirigida a investigadores que inician su carrera en el campo., celebrado el martes, Octubre 19. Diseñado para apoyar a los investigadores deseosos de conectarse con otros investigadores y acceder a los recursos necesarios para el descubrimiento científico., la sesión fue un gran éxito con 95 asistentes totales.
Esta sesión presentó a los asistentes todo lo que necesitan saber para utilizar datos y recursos a través del recurso de datos Kids First.. Anfitrión: Dr.. David Higgins, Gerente del Programa de Comunidad Científica para Kids First DRC, La concurrida sesión llevó a los participantes a través de los conjuntos de datos disponibles., varios componentes del portal, y los recursos puestos a disposición para garantizar que todos los investigadores aprovechen al máximo lo que KFDRC tiene para ofrecer. Esos recursos incluyen oportunidades de capacitación., Tuberías Kids First, e información de contacto del servicio de asistencia de Kids First. La sesión fue grabada., y está disponible para ver en nuestro Canal de Youtube.
Además de la presentación, Kids First estuvo representado en varias sesiones de carteles por investigadores de todo el mundo..
Yiran Guo, Investigador de Kids First y bioinformático del Centro de Descubrimiento Basado en Datos en Biomedicina (D3b) en el Hospital Infantil de Filadelfia (CORTAR) presentó su trabajo, Haciendo descubrimientos con Kids First Variant Database, a los asistentes a la conferencia a través de una sesión de carteles el lunes, Octubre 18. Recientemente, Se han añadido dos nuevos componentes al Portal de niños primero: la base de datos de búsqueda de variantes y el banco de trabajo de variantes. Ambos componentes permiten a los investigadores centrarse en variantes genéticas de la línea germinal, Mutaciones en el ADN que pueden transmitirse de padres a hijos.. Si bien Variant Database proporciona resúmenes de tales mutaciones, Variant Workbench permite a los investigadores utilizar lenguajes de programación como Python, Chispa - chispear, SQL, y Markdown para un análisis aún más profundo.
Utilizando el banco de trabajo variante, El trabajo de Guo implica la detección de genes receptores del factor de crecimiento de fibroblastos. (FGFR), genes asociados con el crecimiento del tejido conectivo, para mutaciones encontradas en genes en el riñón y el tracto urinario. El análisis de Guo identificó una variante en un gen FGFR específico que probablemente causa enfermedades y se ha relacionado con múltiples trastornos genéticos autosómicos dominantes.. Este trabajo podría avanzar en la comprensión de los trastornos asociados con esta variación y mejorar las vías hacia tratamientos más efectivos..
En la misma sesión, Investigadores destacados de UCLA presentaron su uso de datos de secuenciación del genoma completo de Kids First Data Resource para comprender mejor los antecedentes genéticos de las enfermedades cardíacas congénitas. (enfermedad coronaria) mediante el desarrollo de puntuaciones de riesgo poligénico (PRS). Los PRS se desarrollan analizando los efectos de muchas variaciones diferentes., o mutaciones, del genoma y las conexiones que estas variaciones tienen con una enfermedad específica. Los investigadores plantearon la hipótesis de que la PRS podría identificar casos de enfermedad coronaria que pueden explicarse por variantes genéticas comunes. Los investigadores también plantearon la hipótesis de que la PRS estará relacionada con la gravedad de la enfermedad.. Este equipo desarrolló con éxito una PRS para CHD utilizando datos disponibles a través de una cohorte de CHD del KFDRC.. Este trabajo podría ayudar a explicar la base genética de la enfermedad coronaria porque el desarrollo de estas PRS muestra que variantes comunes pueden contribuir al riesgo y la gravedad de la enfermedad coronaria.. Esta comprensión más profunda de la enfermedad coronaria allana el camino para nuevos descubrimientos en el tratamiento de problemas de salud relacionados con la enfermedad coronaria..
Otro grupo de destacados investigadores de la Universidad Emory presentó su trabajo, centrado en mutaciones de novo en elementos reguladores craneofaciales en tríos con hendiduras orofaciales (OCF). Los OFC son el defecto congénito más común que afecta la cabeza y la cara., presentar en 1 en 700 nacimientos. Nuevamente mutaciones (DNM) Son mutaciones en el ADN de un individuo que se originaron en el espermatozoide o el óvulo de su progenitor.. Como otros defectos congénitos estructurales, A menudo se encuentra que los genes relacionados con OFC tienen muchos de estos DNM presentes.. Sin embargo, La contribución de estos DNM a la formación de OFC no se comprende bien.. Los investigadores analizaron los datos de secuenciación del genoma completo disponibles a través de Kids First Data Resource e identificaron DNM junto con información relacionada con los cronogramas de desarrollo humano para determinar el impacto potencial de dichos DNM.. Los resultados de este análisis sugieren que los individuos con OFC tienen una mayor presencia de DNM en regiones que son importantes durante el desarrollo craneofacial.. Por lo tanto, Este trabajo profundiza la comprensión de los DNM como contribuyentes a la formación de OFC..
Por último se realizó una presentación sobre Escoliosis idiopática del adolescente (AIS), una deformidad común de la columna que afecta a los niños. AIS es hereditario, lo que significa que se transmite del ADN de los padres al ADN del niño., sin embargo, las ubicaciones específicas de los genes relacionados con AIS no se han apreciado completamente.. Investigadores del Rito Escocés para los Niños colaboraron con el Kids First Data Resource Center para realizar un metanálisis de genes relacionados con el desarrollo del cartílago, para comprender mejor los orígenes genéticos del AIS. Los investigadores realizaron la secuenciación completa del genoma en 72 familias con AIS. Este análisis resultó en la identificación de mutaciones raras en múltiples familias.. Estas mutaciones estaban en HAPLN1, un gen que codifica proteínas responsables de estabilizar el cartílago y los discos intervertebrales uniéndose a moléculas más grandes que se encuentran fuera de la célula en la matriz extracelular (ECM). La evidencia anterior sugiere que HAPLN1 estimula la producción de ECM. Usando CRISPR, Los investigadores diseñaron ratones que tienen las variaciones de HAPLN1 identificadas en la secuenciación del genoma., HAPLN1^C306FS5 y HAPLN1^C306S. Ratones diseñados con HAPLN1^C306FS5 La variación nació viva con defectos estructurales y murió poco después.. Sin embargo, Los ratones diseñados con la variación HAPLN1^C306S nacieron sin defectos estructurales y no mostraron anomalías significativas a medida que envejecían.. Colectivamente, Los datos de este trabajo sugieren que la pérdida de HAPLN1 asociada a la ECM puede contribuir al AIS heredado., ampliando así la comprensión de esta condición y sus orígenes.
En general, ASHG 2021 fue un gran éxito en la promoción de la misión y el impacto del Centro de recursos de datos Gabriella Miller Kids First, conectando a los investigadores con nuestras herramientas, y continuar fomentando las relaciones dentro de la comunidad genética. Para obtener más información y registrarse en Kids First Data Resource, Visitanos en kidsfirstdrc.org/portal/portal-features/ o contáctanos al apoyo@kidsfirstdrc.org
