这 美国人类基因组学学会 (ASHG) 是首屈一指的人类遗传学专家专业会员组织, 拥有近 8,000 世界各地的专业人士. 每年一个 ASHG 会议 举办该领域的专家聚集在一起分享新兴科学, 工具, 和框架.
NIH 共同基金支持的 Gabriella Miller Kids First 数据资源中心 (儿童第一刚果民主共和国) 很高兴再次参加年会, 从 10 月开始在 Zoom 上虚拟举行 18 到 22. 为了 2021 会议, Kids First DRC 进行了特别演示和问答&面向该领域早期职业研究人员的会议, 周二举行, 十月 19. 旨在支持渴望与其他研究人员建立联系并获取科学发现所需资源的研究人员, 会议取得巨大成功 95 总出席人数.
本次会议向与会者介绍了通过“儿童优先数据资源”利用数据和资源所需了解的一切. 主持人：博士. 大卫·希金斯, Kids First DRC 科学界项目经理, 参加人数众多的会议让参与者了解了可用的数据集, 各种门户组件, 以及可确保所有研究人员充分利用 KFDRC 提供的资源的资源. 这些资源包括培训机会, 儿童第一管道, 以及 Kids First 服务台的联系信息. 会议已被记录, 并且可以在我们的网站上查看 YouTube 频道.
除了演示之外, 来自世界各地的研究人员代表“儿童第一”参加了多次海报会议.
Yiran Guo, 生物医学数据驱动发现中心的儿童第一研究员和生物信息学家 (D3b) 在费城儿童医院 (劈) 展示了他的作品, 使用 Kids First 变体数据库进行发现, 周一通过海报会议向与会者展示, 十月 18. 最近, 两个新组件已添加到 儿童第一门户网站: 变体搜索数据库和变体工作台. 这两个组件使研究人员能够专注于种系遗传变异, DNA 突变可以从父母遗传给孩子. 虽然变体数据库提供了此类突变的摘要, Variant Workbench 允许研究人员使用 Python 等脚本语言, 火花, SQL, 和 Markdown 进行更深入的分析.
使用变体工作台, 郭的工作涉及筛选成纤维细胞生长因子受体基因 (成纤维细胞生长因子), 与结缔组织生长相关的基因, 用于肾脏和泌尿道基因中发现的突变. 郭的分析发现了特定 FGFR 基因中的一个变异，该变异可能导致疾病，并且与多种常染色体显性遗传疾病有关. 这项工作可以增进对与这种变异相关的疾病的理解，并增强更有效治疗的途径.
在同一个会话中, 加州大学洛杉矶分校的主要研究人员介绍了他们如何利用 Kids First 数据资源中的全基因组测序数据来更好地了解先天性心脏病的遗传背景 (冠心病) 通过多基因风险评分的发展 (PRS). PRS 是通过分析许多不同变化的影响而制定的, 或突变, 基因组以及这些变异与特定疾病的联系. 研究人员假设 PRS 可以识别可由常见遗传变异解释的冠心病病例. 研究人员还假设 PRS 与疾病的严重程度有关. 该团队利用 KFDRC 的 CHD 队列提供的数据，成功开发了针对 CHD 的 PRS. 这项工作可能有助于解释 CHD 的遗传基础，因为这些 PRS 的发展表明常见变异可能会导致 CHD 的风险和严重程度. 对先心病的加深了解为治疗先心病相关健康问题的新发现铺平了道路.
来自埃默里大学的另一组主要研究人员介绍了他们的工作, 专注于口面裂三人组中颅面调节元件的从头突变 (有机碳纤维). OFC 是影响头部和面部的最常见出生缺陷, 存在于 1 在 700 出生. 再次突变 (DNM) 是源自其父母的精子或卵子的个体 DNA 突变. 与其他结构性出生缺陷一样, 经常发现与 OFC 相关的基因存在许多此类 DNM. 然而, 这些 DNM 对 OFC 形成的贡献尚不清楚. 研究人员分析了通过 Kids First 数据资源提供的全基因组测序数据，并确定了 DNM 以及与人类发育时间表相关的信息，以确定此类 DNM 的潜在影响. 该分析结果表明，具有 OFC 的个体在颅面发育过程中重要的区域中 DNM 的存在增加. 所以, 这项工作加深了对 DNM 作为 OFC 形成贡献者的理解.
最后是关于青少年特发性脊柱侧凸的演讲 (船舶自动识别系统), 影响儿童的常见脊柱畸形. AIS具有遗传性, 这意味着它是从父母 DNA 遗传给孩子 DNA 的, 然而AIS相关基因的具体位置尚未得到充分了解. 苏格兰儿童仪式的研究人员与儿童第一数据资源中心合作，对与软骨发育相关的基因进行了荟萃分析, 更好地了解 AIS 的遗传起源. 研究人员进行了全基因组测序 72 患有 AIS 的家庭. 该分析导致多个家族中罕见突变的鉴定. 这些突变位于 HAPLN1, 编码蛋白质的基因，通过与细胞外细胞外基质中发现的较大分子结合，负责稳定软骨和椎间盘 (细胞外基质). 先前的证据表明 HAPLN1 刺激 ECM 产生. 使用CRISPR, 研究人员对小鼠进行了基因改造，使其具有基因组测序中发现的 HAPLN1 变异, HAPLN1^C306FS5 和 HAPLN1^C306S. 使用 HAPLN1^C306FS 改造的小鼠5 变异体出生时就带有结构缺陷，不久后就死亡了. 然而, 带有 HAPLN1^C306S 变异的小鼠出生时没有结构缺陷，并且随着年龄的增长也没有表现出明显的异常. 集体, 这项工作的数据表明，ECM 相关 HAPLN1 的丢失可能会导致遗传性 AIS, 从而扩大对这种情况及其起源的理解.
全面的, ASHG 2021 在宣传 Gabriella Miller Kids First 数据资源中心的使命和影响方面取得了巨大成功, 将研究人员与我们的工具联系起来, 并继续培育遗传学界内的关系. 了解更多信息并注册 Kids First 数据资源, 请访问我们 kidsfirstdrc.org/portal/portal-features/ 或联系我们 support@kidsfirstdrc.org
