NIH 共同基金的 Gabriella Miller Kids First 儿科研究计划为所有研究人员提供云信贷
分析大量数据需要相当大的计算能力和能力. 在处理儿童癌症和结构性出生缺陷研究产生的丰富数据时尤其如此. 历史上, 大规模数据分析需要使用位于本地的物理计算机系统. 基因组数据的规模和大小不断增加意味着将这些文件移动到安装软件的机构位置正在成为一种负担. 幸运的是, 基于云的分析提供了另一种选择——将相对较小的软件文件移动到存储数据的位置.
现在, 最近宣布的通过美国国立卫生研究院提供的云积分试点计划 (NIH) 共同基金 加布里埃拉·米勒儿童第一儿科研究计划 (孩子第一) 为儿童癌症和出生缺陷研究人员提供更多机会利用基于云的数据管理并开展合作.
高性能计算会产生大量前期成本，需要将服务器和存储设备网络部署在单个机构中. 然而, 基于云的计算允许访问相同的基础设施，而无需拥有和管理机器本身. 研究人员可以利用云计算在这种环境中根据其使用量进行工作. 分析开始时可以快速启动数十台机器 – 一旦工作完成并且不再需要它们，就尽快关闭.
卡瓦蒂卡 是一个基于云的门户环境，旨在安全地存储, 分享, 分析大量基因组数据以加速儿科研究合作. 该平台还提供在用户请求时激活和停用这些计算机的服务. 这使得研究人员能够专注于其项目的生物学和生物信息学方面, 无需从头开始建立云基础设施. 云计算还允许用户与协作者无缝共享数据. 任何协作者都可以创建帐户并获得对同一平台的访问权限. 有用的数据产品, 工具, 结果发表后还可以快速传播并与更广泛的研究界共享.
不断发展的社区
Kids First Cloud Credits Pilot 现已推出，使所有研究人员能够进行基于云的分析，同时利用 Kids First 数据资源中心提供的数据和资源.
Kids First 数据资源使用 Gen3 Data Commons 框架和 CAVATICA 基于云的分析平台，使社区研究人员能够将基于云的工具引入数据. 这 Kids First 数据资源门户 是数据的入口点，研究人员可以在其中查询信息并构建综合队列. 卡瓦蒂卡 允许用户从多个资源中提取数据并构建自己的工作流程或从现有的资源中进行选择.
申请 Cloud Credits 计划可以帮助研究人员降低使用这些工具的障碍, 支持在这些基于云的平台上进行协作, 构建和共享工作流程, 并在一个云工作区中分析“儿童优先”和“非儿童优先”数据. 一旦您提交请求, 云学分试点的申请人应在四六周内获得 NIH 的批准, 允许近乎立即利用这些资源. 所有请求都将由 NIH Kids First Cloud Credits 审查委员会进行审查.
该云积分试点可以为研究人员提供完成小型项目或收集足够的初步数据以申请 NIH 资助的赠款的机会, 比如它的 R03 小额研究资助计划, 目前正在接受研究资助提案，以通过“儿童优先”分析数据.
Cloud Credits Pilot 以 Kids First 数据资源为基础，增强了协作的可能性. 合作者不仅将为儿童优先计划支持的不断发展和发展的儿童癌症和出生缺陷研究社区做出贡献, 但获得学分的人的工作将丰富该计划本身.
如果您想参加“儿童优先”活动 2022 云积分试点, 请立即联系. 如有任何问题, 请联系: KidsFirst@od.nih.gov “孩子第一 2022 主题行中的“云积分试点”, 项目工作人员将跟进提供更多信息.
