文章由澳大利亚研究数据共享中心提供
在澳大利亚，儿童癌症导致的儿童死亡人数比任何其他疾病都多，悲惨的是, 目前澳大利亚每周有三名儿童和青少年因癌症死亡.
每个孩子都是不同的, 每种癌症都是独特的, 因此治疗必须针对每个人量身定制. 个性化医疗, 医生和研究人员需要使用最新的创新和技术，能够对个体儿童的癌症提供独特的见解，从而能够识别最有效地针对其癌症的药物.
输入卡瓦提卡 – 基于云的协作访问平台, 分享, 并分析儿童癌症数据. 该平台允许世界各地的科学家在计算和存储环境中快速访问大量基因组数据和工作流程，并在其中共享, 过程, 整合, 并分析数据. 使用各种开源 R 和 Python 包可以实现复杂的比较分析; 并通过 CAVATICA 的数据分析器, 可以通过交互式 Jupyter Notebooks 和 RStudio 共享数据.
澳大利亚研究数据共享中心 (ARDC), 与澳大利亚 Bioplatforms 合作, 澳大利亚生物共享区, 澳大利亚儿童癌症研究所, 生物医学数据驱动发现中心 (D3b) 在美国, 和七桥, 一直致力于扩展 CAVATICA 以利用悉尼的 Amazon Web Services，并试点新功能以支持澳大利亚的零儿童癌症计划*.
马克·考利副教授, 儿童癌症研究所计算生物学组组长, 表示 CAVATICA 的扩展已经通过提供更简单、更快捷的方法来共享数据和分析罕见的儿童癌症数据，增强了国际合作.
“由于我们对许多儿童癌症亚型知之甚少, 我们必须在全球范围内共享数据. 通过将澳大利亚患者的肿瘤与大量美国患者进行比较，我们也许能够更好地了解如何治疗该患者的肿瘤.
“CAVATICA 的创新技术使澳大利亚和美国的研究人员能够轻松无缝地共享数据和新颖的分析方法, 推动改善成果和新颖研究,”考利副教授说.
ARDC, 澳大利亚生物共享区, 儿童癌症研究所于二月初举办了一系列研讨会和网络研讨会 2020. 由艾莉森·希思博士主讲, 数据技术与创新总监, D3b 费城儿童医院, 提供网络研讨会和培训讲习班:
-CAVATICA 概述
-如何使用 CAVATICA 创建数据分析和共享工具
-如何访问和利用现有的生产工作流程.
加布里埃拉米勒儿童第一数据资源中心 (儿童第一刚果民主共和国) 管理结构性出生缺陷和儿科癌症的基因组数据. Kids First DRC 使用 CAVATICA 来协调和处理 15,000 全基因组, 全外显子组, 和RNA测序, 包括对齐, 体细胞变异检出, 结构变体, RNA表达和融合.
请访问 CAVATICA 的专门网站，了解有关该平台的更多信息，并详细了解 ARDC 如何与国家和国际组织合作，帮助澳大利亚研究人员治愈患有癌症的儿童.
*零儿童癌症计划是儿童癌症研究所和儿童癌症中心的联合倡议, 悉尼儿童医院, 兰德威克
